XJR400R был выпущен как топовая модель 4-цилиндрового нейкеда XJR400 с воздушным охлаждением, выпущенного в 1993 году. Дебютировал в феврале 1995 года. В то время также продавался XJR400, и это была комбинация базовой модели и продвинутой модели. Базовая конфигурация, такая как рама и двигатель, такая же, как и у базовой модели, а XJR400R был оснащен задней подвеской Ohlins и тормозными суппортами Brembo. В январе 1996 года к модельному ряду был добавлен XJR400RII с угловой подсветкой на капоте бикини, и в какой-то момент серия XJR400 состояла из трех моделей. Первое незначительное изменение в 1998 году. Помимо изменения внешнего вида, объем бака увеличился до 20 литров (ранее 18 литров). Следующее крупное усовершенствование было в 2001 году. Карбюратор и заднее колесо новые, а передняя и задняя шины радиальные. После этого, в 2004 году, противоугонное устройство стало стандартным оборудованием, но в...
XJR400R был выпущен как топовая модель 4-цилиндрового нейкеда XJR400 с воздушным охлаждением, выпущенного в 1993 году. Дебютировал в феврале 1995 года. В то время также продавался XJR400, и это была комбинация базовой модели и продвинутой модели. Базовая конфигурация, такая как рама и двигатель, такая же, как и у базовой модели, а XJR400R был оснащен задней подвеской Ohlins и тормозными суппортами Brembo. В январе 1996 года к модельному ряду был добавлен XJR400RII с угловой подсветкой на капоте бикини, и в какой-то момент серия XJR400 состояла из трех моделей. Первое незначительное изменение в 1998 году. Помимо изменения внешнего вида, объем бака увеличился до 20 литров (ранее 18 литров). Следующее крупное усовершенствование было в 2001 году. Карбюратор и заднее колесо новые, а передняя и задняя шины радиальные. После этого, в 2004 году, противоугонное устройство стало стандартным оборудованием, но в основном оно продолжилось с цветовыми вариациями, а модель 2007 года стала последней моделью, выпавшей из каталога. Наряду с Zephyr χ (до 2008 г.) это был последний оставшийся 4-цилиндровый нейкед с воздушным охлаждением.
Вариация модели с нагрудником-капюшоном, напоминающая гонки на нейкед-байках «НК4». Изменения по сравнению с XJR400R включают в себя более тонкую фару с добавлением капота, улучшенные характеристики управляемости за счет использования легкого цифрового индикатора, а также использование запатентованного Yamaha амортизирующего материала Wirax в сиденье. Изменение материала сиденья не только улучшает посадку во время вождения, но и снижает высоту сиденья на 10 мм.