Версия Baja, появившаяся с дебютом XR250 (Super XR), которая реализовывала внедорожные мотоциклы для дорог общего пользования (Honda в то время называла их «наземными спортивными мотоциклами») из серии XR, которая была посвящена бездорожью. вождение. Официальное название этой Super XR Baja — «XR BAJA» (без 250). В следующем году он производился до модели 2003 года, претерпев при этом несколько незначительных изменений, таких как увеличение топливного бака (по сравнению с XR250).
Основанный на XR250, он был представлен как модель с изображением гонки Baja на 1000 миль, как и его предшественник XLR250BAJA. Эта ранняя модель XR250 Baja имеет объем топливного бака 9,7 л, такой же, как у XR250.