FZR1000 был разработан как литровый спорткар, оснащенный параллельным 4-цилиндровым двигателем GENESIS от Yamaha, который имеет пять клапанов на цилиндр и цилиндр, наклоненный вперед на 45°. Впервые он появился на Кельнской выставке 1986 года (Германия) и был выпущен в 1987 году. Как автомобиль с двигателем Genesis, это была модель, следующая за FZ750 и FZR750. В 1989 году форма рамы Deltabox была пересмотрена, а в 1990 году к передним вилкам был добавлен механизм первоначальной регулировки нагрузки. Изменение модели этого FZR1000 породило YZR1000R Thunder Ace (1996), за которым последовало громкое имя YZF-R1 (1998). *Эксклюзивная зарубежная модель
Оснащен 989-кубовым 4-тактным параллельным 4-цилиндровым агрегатом с водяным охлаждением и увеличенным ходом цилиндра двигателя FZ750. Это был двигатель GENESIS с 5 клапанами (3 впуска и 2 выпуска) с прямым распредвалом.