Cygnus X SR был выпущен в августе 2004 года как вариация на основе Cygnus X, появившегося в мае 2003 года, со спортивной окраской и улучшенным оборудованием. Хотя базовая конфигурация, такая как одноцилиндровый двигатель объемом 124 куб. см с воздушным охлаждением, была такой же, были даны такие характеристики, как трехступенчатая регулируемая задняя подвеска. Модель 2008 г. была первой сменой модели (впрыск), 3-е поколение в 2013 г. и 4-е поколение в модели 2016 г. Цветные модели (2005 г.), Гран-при мира по шоссейным гонкам (WGP, текущий MotoGP), цвет 50-летия (2011 г.) , и модель ограниченного выпуска (2017 г.), вдохновленная цветом Movistar заводской команды MotoGP. * Начиная с модели 2019 года, название автомобиля было изменено обратно на «Cygnus X» без «SR», поэтому информация, начиная с модели 2019 года, была перемещена в раздел Cygnus X.
В ознаменование 50-летия со дня основания Yamaha была выпущена специальная модель Cygnus X SR 50th Anniversary Special Edition, выпущенная ограниченным тиражом с августа по сентябрь 2005 года. В качестве специального оборудования есть три специальных элемента: желтый цвет кузова, который является символом «US Intercolor», черно-белая стробоскопическая графика, эмблема 50-летия и специальная передняя эмблема.