Ninja ZX-4R SE — это усовершенствованная версия Ninja ZX-4R, анонсированная в феврале 2023 года на зарубежных рынках. Основные технические характеристики, такие как установка параллельного 4-цилиндрового двигателя с водяным охлаждением и рабочим объемом 399 куб. см, такие же, как и у стандартной модели. В спецификации SE он был оснащен квикшифтером, разъемом USB и ползунком двигателя. *По состоянию на 2 февраля 2023 года такой информации, как дата выхода в Японии, нет, но она планируется.
Ninja ZX-4R SE, модель 2025 года с отечественными техническими характеристиками. По сравнению со стандартной моделью (еще не представленной в Японии), версия SE серии Ninja ZX-4R оснащена переключателем быстрого переключения передач вверх/вниз (с мотоциклматическим переключателем), разъемом питания USB, слайдером рамки, и уникальный цвет. Это была модель, в которой использовалось кольцо. Модель 2025 года не имеет изменений ни в характеристиках, ни в оснащении, изменилась лишь цветовая гамма. *Дата выпуска: 1 сентября 2024 г. (рыночный код: ZX400RSFAN)