XR250 (MD30) также называется «Super XR» из концепции разработки. Представленный в 1995 году как преемник XLR250R (в то же время дебютировала и XR Baja), претерпев несколько незначительных изменений и полное изменение модели в 2003 году с добавлением кожуха бака. Причина прекращения производства была связана с правилами выхлопных газов в то время. Во второй половине модель жила отдельно от XR230, а XR230 выпускался и после окончания XR250, но в итоге из каталога выпал. Honda пришлось ждать до выпуска CRF250L в 2012 году для дорожного внедорожного мотоцикла.
Изменив вторичное передаточное отношение (с 13/39 до 13/40), он стал настройкой, которая подчеркивает ускорение. Поворотный рычаг был увеличен на 12 мм (526 → 538 мм) для повышения устойчивости. Большое незначительное изменение с другими изменениями.