В 2018 году Multistrada 1200 превратилась в Multistrada 1260, а его расширенная спецификация «версия S» также стала Multistrada 1260S. Как и у стандартной модели, у Testastretta DVT (компактная головка с механизмом изменения фаз газораспределения) объем двигателя был увеличен до 1262 куб.см, а электронное управление кузовом усовершенствовано. Кроме того, версия S оснащена полуактивной подвеской Ducati Skyhook Suspension (DSS) EVO. В переднем тормозе используется 4-поршневой моноблочный суппорт Brembo M50, а диаметр тормозного диска увеличен до 330 мм. Еще одним элементом был квикшифтер, который позволял переключаться вверх и вниз без использования рычага сцепления. Другие отличия от стандартной модели заключались в том, что фары были полностью светодиодными, оснащены подсветкой поворотов, а приборная панель представляла собой 5-дюймовую полноцветную жидкокристаллическую панель TFT.