Monster 1000S — это модель, являющаяся усовершенствованной версией Monster 1000, появившейся в 2003 году. Тип «S» для Ducati — это в основном модель с улучшенными характеристиками днища, и Monster 1000S не является исключением. Маятник изготовлен из легкого алюминия, а передняя и задняя подвеска (передняя: Showa / задняя: Sachs) заменены на полностью регулируемые, что позволяет регулировать предварительную нагрузку и демпфирующее усилие. Устанавливаемый двигатель такой же, как у Monster 1000, двухклапанный L с воздушным охлаждением и рабочим объемом 992 см³. Из-за двухискрового двигателя с двумя свечами зажигания на цилиндр к названию модели иногда добавляли «DS». Вне зависимости от наличия или отсутствия DS, это будет монстр 1000S.